2003年に再びＪリーグへ戻ったエムボマ！
2003年からはJリーグの東京ヴェルディ1969でプレー。
ガンバ大阪時代のヴェルディの印象は「ビッグクラブ」だったそう。
また、公募により愛称が「ボマちゃん」となり、で親しまれた。スピードや体力の衰えは感じられたものの、持ち前のテクニック、強力なミドルシュートは健在で、経験を生かしたプレーで、多くのディフェンダーを圧倒した。
しかし、当時の監督オズワルド・アルディレスと関係がこじれ、ヴェルディを退団。
その後、ヴィッセル神戸に移籍するものの、最後まで本来の輝きを取り戻せなかった。
2005年は度重なる故障のため4試合出場0得点と精彩を欠き、5月16日に現役を引退した。
東京ヴェルディ1969時代
引退後は、カメルーン代表のアドバイザーを経て、実業家として会社を経営したりと忙しい日々を送っているエムボマ。
2008年にはフランスのアンジェに鈴木規郎が短期留学した際にはコーディネイターを務めた。
FIFA公認代理人としての顔も持つ。
2010年、2022 FIFAワールドカップを日本で開催するための招致アンバサダーに就任した。
日本と縁深いエムボマ。
2002年日韓Ｗ杯時に、カメルーン代表がキャンプ地の中津江村への到着が大幅に遅れたいわゆる「カメルーン騒動」で、久しぶりにエムボマを思い出した方も多かったのではないだろうか。
親日家としても知られ、東京ヴェルディ1969入りする前も、ガンバ大阪時代に日本人が優しく接してくれた経験を忘れていないと発言している。
また、三男の名前を「健志」と名付けている。
